Kartagina

Piąty sektor został odkryty przez dzieciaki w odcinku pod tytułem "Nowe terytorium". Jest to wielka kula unosząca się w przestrzeni. Dotrzeć można do niej poprzez użycie specjalnie zaprojektowanego transportera, który Jeremie przywołuje komendą "Scypion". Sektor ten zapewnia dostęp do danych Xany - w tym celu cała grupa musi przebiec w wyznaczonym czasie przez naszpikowany potworami labirynt. Nie jest to łatwe zadanie, gdyż wewnętrzny wygląd sektora za każdym razem jest inny. Dopiero po dezaktywowaniu odliczania Aelita może korzystać ze znajdującego się na skraju sfery terminala. Pierwsza wizyta w Kartaginie była wielkim zaskoczeniem dla bohaterów, gdyż Aelita na powitanie została zaatakowana przez Sctyfozoę, która miała za zadanie wykraść z jej pamięci otrzymane od ojca klucze do Lyoko. Nazwa sektora wiąże się z nazwą wojskowego programu Kartagina, który miał zostać zniszczony przez Xanę.
Z biegiem czasu Jeremie opracował sposób wirtualizacji bohaterów bezpośrednio w piątym sektorze. Kartagina znajdująca się w centrum Lyoko, pomiędzy wszystkimi czterema sektorami wpisuje się w powiedzenie, że wszystkie drogi prowadzą do Rzymu... a raczej wszystkie kable prowadzą do Kartaginy. Piąty sektor stanowi największe skupisko energii i mocy obliczeniowej przez co Jeremie wykorzystuje go do uruchomienia największych programów. W drugim i trzecim sezonie piąty sektor odgrywa ważną rolę dając dostęp do danych na temat Xany, Franza Hoppera czy też chroniąc Serce Lyoko. Sytuacja zmienia się w sezonie czwartym, kiedy to Kartagina spada na drugi plan na rzecz replik.
Od odkrycia "piątki" w odcinku "Nowe terytorium", sektor ten pojawił się łącznie w 25 epizodach.